В 1939 году Микоян был руководителем особого конструкторского отдела, который занимался разработками скоростных истребителей. Именно там перед самым началом Великой Отечественной войны был создан первый МиГ – самолёт, названный по первым буквам фамилий Микояна и его коллеги Михаила Гуревича.

МиГ-1 создавался в сжатые сроки, поэтому имел много недостатков. Устранить их удалось в следующей модификации, МиГ-3. На высоте свыше 7 000 км этот самолёт развивал наивысшую для того времени скорость – 640 км/ч. МиГ-3 мог подниматься на 12 тысяч метров, что позволяло успешно бороться с самыми высотными самолётами противника. Именно на МиГ-3 одержал свою первую победу над немецким «Мессершмиттом-109» один из самых знаменитых советских асов Александр Покрышкин.

Под руководством конструкторов Микояна и Гуревича в период с 1941 по 1945 год было разработано 15 самолётов с высокими лётно-техническими характеристиками.

Самолёты опытно-конструкторского бюро (ОКБ) им. А. И. Микояна и сегодня составляют основу боевой мощи воздушных сил России.