Особенно сложно было замаскировать водный транспорт: корабли, катера и лодки.

На палубах кораблей строили бутафорские деревенские дома и сараи, «сажали» огороды. Для камуфляжа часто использовали камыш и побеги кукурузы, применяли маскировочную окраску. Но немецкие пилоты-разведчики быстро распознавали маскировочную сеть по наличию в ней ненастоящих или увядших растений.

Тогда учёные-ботаники разработали технологию консервирования срубленных деревьев и ветвей, которая позволяла надолго сохранять естественный цвет маскировочных материалов.

Приходилось прибегать и к другим хитростям. Так, на Неве стоял крейсер «Киров», накрытый маскировочной сетью. Неподалеку от него установили сухогруз-дублёр, который сделали максимально похожим на крейсер. Он-то и отвлекал на себя атаки врага.